Spørsmål:
Karbonsvovelbindingslengder; Resonanseffekter (eller mangel på disse)
Dissenter
2014-10-22 19:07:31 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Hvorfor er CS-obligasjonen i $ \ ce {CH_2SH ^ -} $ lenger enn i $ \ ce {CH_3SH} $? Ville det ikke være resonans i den tidligere, noe som tvinger CS-obligasjonen til å trekke seg?

http://www.nrcresearchpress.com/doi/pdf/10.1139/v75-431

enter image description here

enter image description here

Er det også noen ikke ab initio beregninger / empiriske studier på dette interessante tiolionet mens vi er i gang?

Av nysgjerrighet, hva er denne artikkelen - kan du gi en DOI-lenke? Jeg er nysgjerrig på hvilket nivå av teori som ble gjort. En naiv tanke er at det kan være noe triplettkarakter i anionet.
Det vil også være syn- / anti- (eller cis- / trans-) geometri-problemer med $ \ ce {CH2SH -} $ som kanskje ikke har blitt vurdert (dvs. jeg mistenker at hver form vil ha litt forskjellige bindingslengder .. i hovedsak på grunn av forskjeller i dobbeltbindingsresonansbildet)
@GeoffHutchison er ikke det du har TA for? Beklager, her er riktig lenke: http://www.nrcresearchpress.com/doi/pdf/10.1139/v75-431
Wow, dette er et * gammelt * papir som bruker vanlig Hartree-Fock. Kanskje noen kan gjøre en oppdatert beregning her.
Jeg er mest interessert i empiriske beregninger lol. Fordi hvis jeg viser profen min denne artikkelen, vil jeg bli opptatt av beregningskemikere, ahem, jeg mener "kjemikere." Det er bare hans POV skjønt.
Hvordan vil du kunne måle dette empirisk? Det vil si hvordan ville du være i stand til å lage et karbonanion i nærvær av en fri tiol?
@jerepierre gassfase? Og hold konsentrasjonen _ veldig_ lav. Jeg tror ikke karboanionen vil danne en tre-leddet ring og spise halen.
Starter fra hva skjønt?
Kan du forklare hva du synes er interessant med dette stoffet om et annet emne?
Start fra $ \ ce {H3CSH} $? Du har rett, selv om jeg ikke kan se hva som selektivt vil fjerne en metylproton i stedet for en tiolproton. Så sier du at det er umulig?
Hvorfor er CS-bindingslengden til anionet lengre enn CS-bindingslengden i den nøytrale tiol? Til tross for muligheten for resonans.
La oss [fortsette denne diskusjonen i chat] (http://chat.stackexchange.com/rooms/18083/discussion-between-jerepierre-and-dissenter).
I alle fall @GeoffHutchison mener jeg ikke å fornærme deg, hvis det ikke var klart i mitt forrige innlegg om hva profen min mener. Det er det han tenker, ikke meg. Personlig vil jeg bevise min prof feil om svovelens bindingstendenser (derav dette spørsmålet ...)
To svar:
Geoff Hutchison
2014-10-23 01:21:24 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Hurtig oppsummering

koblet papir (fra 1975) er sannsynligvis feil . Et litt nyere papir ( J. Am. Chem. Soc., 1989, 111 (21), s. 8112–8115) antyder at obligasjonslengdene er omtrent like store. Noen raske beregninger (nedenfor) ved bruk av flere moderne metoder antyder at, som forventet, CS-obligasjonslengden i $ \ ce {CH2SH -} $ er kortere enn i $ \ ce {CH3SH} $.

For begge eldre papirer vil beregningsresultatene (ved hjelp av grunnleggende Hartree Fock) bli ansett som svært mistenkelige under moderne fagfellevurdering, siden Hartree Fock er kjent for å ha problemer med anioner. Absolutt nevner 1975-papiret ikke engang basis settet.

Sett nedenfor, er det klart at resultatene er metodeavhengige, men den beste nåværende metoder, med rimelige basissett, indikerer at bindingslengden er minst litt kortere på grunn av noe delvis dobbeltbindingskarakter.

Flere detaljer

Den første tingen å vurdere i dette er at det er to former for $ \ ce {CH2SH -} $, syn og anti , basert på retningen til den formelt C-bundne anionen og SH-gruppen:

syn form

syn-CH2SH- anion

anti form

anti-CH2SH- anion

Disse vil ha forskjellige bindingslengder, siden anti skjemaet vil ha bidrag fra resonansstrukturer II og III fra Rons svar . Dette gir noe dobbeltbindingskarakter og bør sannsynligvis ha en kortere binding, selv om elektrostatisk frastøtelse også kan påberopes.

Formen syn vil ikke ha en klar effekt, siden C anion ensomme par og S ensomme par er på motsatt side av bindingen. Jeg antar at obligasjonslengden er omtrent den samme som $ \ ce {CH3SH} $.

Jeg tror den klare meldingen er at vi kan forklare mange ting, men det er bedre å vite om resultatene våre er nøyaktige før du prøver å forklare dem.

Det jeg ser med mer moderne beregningsmetoder er at skjemaet syn har lignende CS-bindingslengde til $ \ ce {CH3SH} $, og anti -formen er litt kortere . Jeg mistenker at forrige resultat ganske enkelt er feil . Beregninger som involverer anioner er vanskelige, siden ekstra elektronet vanligvis er svært diffust. Jeg forventer at basissettet rett og slett ikke var tilstrekkelig.

Forskjellen i energi mellom de to formene er ~ 1 kcal / mol, så eksperimentelt vil disse konvertere lett, og en gjennomsnittlig bindingslengde vil bli observert. Som nevnt i kommentarene, vil denne arten trolig være vanskelig å observere, selv i gassfasen, siden $ \ ce {CH3S -} $ er mer stabil.

Beregnede CS-bindingslengder (i Å):

For alle metoder ble optimal geometrioptimalisering utført ved hjelp av de angitte metodene. Jeg vil anse CCSD-beregningene for å være av høy kvalitet.

bond length table

Er det mulig å lage -H2CSH
Bleh. Jeg lager et bedre bord senere. Det er nok å si at resultatene er metodeavhengige, og * syn * -formen er omtrent den samme som CH3SH. Jeg vil gi bedre resultater senere.
@GeoffHutchison Geoff, i vann hybridiseres de 2 ensomme parene forskjellig, det ene i det meste p-orbital, det andre i en grovt sp-orbital. Hvordan behandler du de ensomme parene i beregningene dine?
@ron Dette er MO-beregninger med full $ C_s $ symmetri for $ \ ce {CH2SH -} $ anion, og det er derfor ingen forestilling om hybridisering av ensomme par i disse beregningene.
Jeg lurer på energiforskjellen mellom syn og anti. Det kan ikke være mye, og mest sannsynlig kan det betraktes som en gratis rotasjon, og derfor vil gjennomsnitt være passende.
Energidifferansen ser ut til å være ~ 1 kcal / mol uavhengig av metode, og derfor ville gjennomsnittet absolutt være passende. Det er imidlertid interessant at forskjellen i CS-obligasjonslengde noen ganger er ganske betydelig.
ron
2014-10-22 23:26:39 UTC
view on stackexchange narkive permalink

For det første er forskjellen vi snakker om bare 0,074 A, det er alltid vanskelig å være sikker på hva som forårsaker så små endringer. Når det er sagt ...

Mengden negativ ladning på karbonatomet i $ \ ce {CH3-SH} $ (-0,639) overrasker meg; det er faktisk mer enn i tilsvarende anion $ \ ce {CH2 ^ {-} - SH} $ (-0,620). Legg også merke til den betydelig større positive ladningen på karbonhydrogenene i $ \ ce {CH3-SH} $. Kanskje antyder dette at hyperkonjugerte resonansstrukturer som jeg er viktige i $ \ ce {CH3-SH} $. Dette vil føre til at $ \ ce {C-S} $ obligasjonen blir forkortet til å begynne med.

enter image description here

Så, når det gjelder anionet, antyder resonansstrukturene II og III at det er merkbar negativ ladning på både karbon og svovel, i samsvar med den høye $ \ ce {q_ {b}} $ og $ \ ce {q_ {c}} $ verdier rapportert i tabell I (henholdsvis -0,620, -0,328). Den merkbare negative ladningen på både karbon og svovel, i anionet, resulterer i coulombisk frastøting og en liten forlengelse av karbon-svovelbindingen, fra den noe forkortede bindingslengden observert i den nøytrale forbindelsen.

Kan du tenke på uansett, vi kan studere dette tiolionet empirisk?
Jeg vil kjøre beregninger på de tilsvarende tioetrene og se om det samme mønsteret holder. Hvis den gjør det, bør anionen være tilgjengelig fra thioetheren.
Hvordan vil du gå fra tioeter til tio-anion? Jeg kan tenke meg å måtte klyve SR-båndet ... men da ... må vi stikke et proton i stedet for R for å lage S-H. Hvordan kan vi selektivt sette H på S i stedet for på CH2 (-)? @ron
Vi setter ikke en proton på S. Vi vil bare trekke en proton av metylen i tioeteren, det er alt, og da vil vi ha en karbanion alfa til svovel.
men så har vi en induktivt donerende metyl fast på svovelets andre side også. Det jeg tenkte på tidligere med noen var hvordan lager vi -CH2SH slik at vi kan studere det empirisk? Noen beskyttelsesgrupper for å beskytte thiolens proton? Og noen måte å selektivt sette tilbake protonen på S?
@Dissenter Riktig, det er derfor jeg sa at jeg først skulle beregne for å sikre at forkortingseffekten fremdeles oppstår i thioether-serien.
kan vi skjønne -CH2SH?
@Dissenter Det er CH3SCH3 jeg refererer til.
Jeg forstår, jeg er bare nysgjerrig på om syntese av anionet er mulig
Spesielt H2CSH-anionet, siden du helt klart vet mer om å beskytte grupper. Eller er realiteten i syre / basiskjemi uunngåelig? Jeg tenker at et smart-ass svar vil være ja, selvfølgelig kan vi klare det, bare ioniser en million mol CH3SH og håper at sannsynligheten er i din favør!
@Dissenter Ja, jeg mistenker at det kunne genereres i gassfasen, men ville omorganiseres veldig raskt (det er sååå nedoverbakke fra CH2- til RS-), kanskje for raskt til å foreta de målingene som trengs.
Kan vi zappe ett molekyl isolert og håpe på det beste?
Det er et [papir] (http://dx.doi.org/10.1021/ja00203a007) som antyder at det kan være stabilt, men jeg finner ingen manuskripter på dette eksperimentelt, bortsett fra fragmentering av massespekter.
Dissenter spurte: "Kan vi zappe ett molekyl isolert og håpe på det beste?" Det er hva gassfaseeksperimentet er. Men som sagt, ville jeg ha gjettet at intramolekylær 1,2 hydrogenforskyvning fra S til C ville være for rask til å gi nok tid til å registrere et mikrobølge-spektrum (for å bestemme bindingslengder) av det opprinnelig genererte karbonbaserte anionet. Men @GeoffHutchisons referanse antyder at en merkbar barriere (46 kcal / m) er beregnet for hydrogenskiftet i det tilsvarende oksygentilfellet. Jeg antar at det er derfor vi gjør eksperimenter.
@ron Jeg vil til og med gjette at det er en betydelig H-tunnelfrekvens i * syn * -form (eller en inversjon fra * anti * til * syn * etterfulgt av H-skift). Så jeg er enig i at det i det minste ville være tøft. Dessverre gikk mikrobølgeeksperten av med pensjon for noen år siden, så jeg kan ikke spørre.


Denne spørsmålet ble automatisk oversatt fra engelsk.Det opprinnelige innholdet er tilgjengelig på stackexchange, som vi takker for cc by-sa 3.0-lisensen den distribueres under.
Loading...